Tuy nhiên, trong thời cơ chế thị trường mở cửa số lượng sinh viên giỏi vào học các ngành khoa học cơ bản có giảm sút gây ra nguy cơ hẫng hụt đội ngũ cán bộ giảng dạy kế cận.Sớm nhận ra thực tế này bắt đầu từ năm 1997-1998, trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội đã mở Hệ Đào tạo Cử nhân Khoa học Tài năng là một bước đột phá như một luồng gió mới trong giáo dục đại học. Chương trình đào tạo cử nhân khoa học tài năng đã thu hút được nhiều sinh viên được giải cao trong các kỳ thi học sinh giỏi quốc gia và quốc tế, tuyển chọn được nhiều học sinh THPT xuất sắc có năng khiếu, có phẩm chất tốt và có hoài bão nhắm bồi dưỡng thành các nhà khoa học và công nghệ xuất sắc đáp ứng yêu cầu cao của sự nghiệp công nghiệp hoá, hiện đại hoá đất nước. Cho đến nay Trường Đại học Khoa học Tự nhiên đã tuyển sinh được 10 khoá Đào tạo cử nhân khoa học tài năng và 4 khoá đào tạo chất lượng cao cho các ngành khoa học Trái đất, đã có 7 khoá sinh viên tốt nghiệp ra trường. Kết quả 10 năm đào tạo Cử nhân khoa học tài năng cho thấy chất lượng đào tạo này được quốc tế thừa nhận; một số sinh viên được các trường đại học nổi tiếng trên thế giới tiếp nhận học chuyển tiếp và đạt kết quả học tập được xếp thứ hạng cao trong các trường này. Từ năm học 2002-2003 Đại học Quốc gia Hà nội từ chương trình Đào tạo cử nhân khoa học tài năng phát triển thành đào tạo nguồn nhân lực tài năng. Chương trình này cho phép những sinh viên tốt nghiệp loại xuất sắc và giỏi được nhận những ưu tiên đặc biệt để thực hiện chương trình đào tạo cao học và nghiên cứu sinh chất lượng quốc tế.

Qua 10 đợt tuyển sinh các mục tiêu cơ bản của chương trình đào tạo cử nhân khoa học tài năng đã đạt được những thành tích đáng khích lệ:

1. Hệ đã thu hút được rất đông học sinh đạt giải Olympic Quốc tế và quốc gia, nhiều học sinh đạt loại giỏi trong 3 năm học trung học phổ thông và đạt kết quả cao trong các kỳ thi tuyển sinh đại học. (Số sinh viên đạt giải quốc tế 102, đạt giải QG 317).

2. Tập hợp được đội ngũ các thầy cô giáo giỏi, các nhà khoa học có uy tín có trình độ chuyên môn cao; có kinh nghiệm giảng dạy và tâm huyết trong và ngoài trường tham gia vào sự nghiệp đào tạo cử nhân khoa học tài năng (50 cán bộ tham gia giảng dạy GS (12), PGS (17), TS (11), GV (10). Tổ chức các lớp chuyên đề về vật lý thiên văn do các Giáo sư nước ngoài giảng dạy và tài trợ. Tổ chức nhiều buổi Semina về các lĩnh vực khác nhau, trong đó có sự tham gia của 2 nhà khoa học được giải thưởng Nobel vật lý thế giới.

3. Đã xây dựng và thực hiện khung chương trình, giáo trình bài giảng được thiết kế riêng nhằm trang bị cho sinh viên một nền kiến thức rộng và sâu nhằm đáp ứng được các yêu cầu:
- Bao phủ các nội dung cơ bản cuả chương trình đào tạo đối với hệ đại trà.
- Khối kiến thức cơ bản chung (gồm các môn Toán học,Vật lý, Hoá học, Tin học) phải đủ rộng và sâu tạo điều kiện thuận lợi cho sinh viên tiếp thu tốt phần kiến thức cơ sở và chuyên nghành.
- Các học phần cốt lõi của khối kiến thức cơ sở chuyên ngành cao hơn so với hệ đại trà.
- Tăng cường kỹ năng thực hành, kiến thức thực tế, khả năng sáng tạo và nghiên cứu khoa học của sinh viên.
- Nâng cao trình độ tiếng Anh ở cả 4 kỹ năng nghe, nói, đọc, viết để đến năm cuối có thể nghe giảng một số môn bằng tiếng Anh.
- Nâng cao trình độ tin học tối thiểu có thể lập trình để giải các bài toán chuyên ngành.

4. Nhà trường đã trang bị đầy đủ và hiện đại cho tất cả các bài thực hành của các môn học trong chương trình, lớp học khang trang có trang thiết bị hiện đại. Sinh viên được cung cấp miễn phí hoặc mượn các bộ giáo trình, sách tham khảo. Hệ thường xuyên tổ chức những đợt tham quan thực tập thiên nhiên nhằm tạo điều kiện cho sinh viên tiếp cận với thực tế và có điều kiện thư giãn sau những kỳ thi căng thẳng. Đã tổ chức được 10 đợt thực tập KHTĐ(10 ngày) 18 đợt tham quan thiên nhiên ngắn ngày.
-Đã xây dựng một thư viện hơn 300 tài liệu, giáo trình và sách tham khảo trong đó có 208 sách tiếng việt, 182 tiếng nước ngoài.
- Sinh viên các tỉnh xa được bố trí nhà ở trong ký túc xá với điều kiện tốt nhất và được hỗ trợ kinh phí.
- Được miễn học phí, được cấp học bổng khuyễn khích tài năng xét theo kết quả học tập. Ngoài các suất học bổng nói trên hàng năm hội Recontres du Việt Nam tại Pháp tài trợ cho Hệ Đào tạo Cử nhân Khoa học Tài năng từ 30-50 suất học bổng mỗi suất 3.000.000đ. Cho đến nay hội này đã tài trợ được > 745 triệu đồng.

5. Tổ chức đào tạo
- Nhà trường đã tổ chức đào tạo chung cho khối kiến thức chung và các kiến thức cơ bản chung của nhóm ngành để trang bị các kiến thức ngành và chuyên ngành. Chương trình đào tạo của Hệ do Ban điều hành trực thuộc Ban giám hiệu quản lý và tổ chức đào tạo (trong 3 học kỳ đầu).

6. Có thể mạnh dạn khẳng định chất lượng đào tạo trong 10 năm qua đã đạt được kết quả cao.
- Số lượng sinh viên theo học ở trường trong 4 năm tỷ lệ xuất sắc và giỏi trên 80%.
- Số sinh viên tham dự các kỳ thi Olimpic gồm các trường đại học trong cả nước về Toán, Lý, Tin hầu hết đều đạt giải 1,2,3.
Sinh viên Hệ đào tạo cử nhân khoa học tài năng tham gia nghiên cứu khoa học rất đông và đạt giải cao cấp khoa, trường và Đại học Quốc gia.
- Cho đến nay đã có 11 sinh viên được kết nạp vào Đảng Khoá1(1SV), K2 (3), K4 (3), K5(2), K6(2).
Sinh viên 7 khoá tốt nghiệp hầu hết đã được chuyển tiếp sinh, cao học. Không ít trong số đó được đào tạo ở nước ngoài như ở Mỹ, Đức, Nhật, Singapor, Hàn Quốc, úc …..(52), trong nước (69).
- Tính đến tháng 6/2007 Hệ đã đào tạo cho nhà trường hơn 40 cán bộ. Nhiều sinh viên sau khi tốt nghiệp đã về công tác tại các trường đại học lớn và các viện nghiên cứu.
- Cho đến nay đã có gần 161 sinh viên các khoá kết thúc năm thứ nhất đã được gửi đi học nước ngoài bằng nhiều con đường khác nhau chủ yếu là ở Pháp, úc, Nga, Nhật. Tróng số đó nhiều người đã học tập tốt đạt thứ hạng cao và được tiếp tục đào tạo Thạc sỹ, Tiến sỹ: Pháp (70), úc (23), Nhật (15) Nga (21), Anh (5), Đức (2), Singapore (15), Hungary (1). Mỹ(2), Hàn Quốc (1)
- 3 sinh viên được chọn trong 10 gương mặt trẻ tiêu biểu của thanh niên cả nước là: Đỗ Quốc Anh (1998), Nguyễn Thanh Lam (1999), Nguyễn Trọng Cảnh (2003), 3 sinh viên là: Bùi Lê Na, Cao Vũ Dân, Cao Thị Phương Anh được xét chọn thanh niên tiêu biểu của thủ đô& Trung ương Đoàn.
- 2 sinh viên được trao giải thưởng “Sao tháng giêng” của Trung ương Hội Sinh viên Việt Nam.
- 18 bằng khen của Trung ương Đoàn đã được trao tặng cho sinh viên Hệ.
- 250 lượt sinh viên của Hệ đã được trao tặng danh hiệu “Gương mặt trẻ tiêu biểu của ĐHQGHN”.

Nguyên nhân thành quả đạt được: Sở dĩ đạt được những thành quả tốt đẹp đó là do:

1. Chủ trương mở hệ đào tạo CNKHTN là một chủ trương đúng xuất phát từ thực tế kết hợp vói đổi mới tư duy, nhạy bén với thời cuộc tạo được giải pháp đột phá nhắm vượt mọi khó khăn đào tạo đội ngũ khoa học tài năng và nâng cao chất lượng đào tạo đạt chuẩn khu vực và quốc tế.

2. Do có sự quyết tâm cao của Ban giám đốc Đại học Quốc gia Hà Nội và sự chỉ đạo trực tiếp của Đảng uỷ Ban Giám hiệu Trường Đại học Khoa học Tự nhiên.

3. Đã tuyển chọn được đội ngũ học sinh giỏi có tư duy tốt, hoài bão lớn quyết tâm cao nỗ lực học tập và rèn luyện.

4. Đã tập hợp được đội ngũ cán bộ giảng dạy có trình độ và kinh nghiệm cao có tâm huyết đối với đào tạo thế hệ trẻ.

5. Có chế độ khuyến khích về vật chất thích đáng trong tổ chức đào tạo bồi dưỡng cho giáo viên, học bổng cho sinh viên …

6. Có tổ chức tốt, phát huy trí tuệ tập thể trong việc điều hành tổ chức đào tạo từ trên xuống dưới. Ban Điều hành đã phân công một Phó Ban kiêm chủ nhiệm lớp, thường xuyên theo dõi quá trình học tập sinh hoạt và đời sống của sinh viên và có mối liên hệ chặt chẽ với phụ huynh học sinh.

7. Được nhà nước quan tâm đặc biệt, dư luận xã hội đồng tình khích lệ.

Với những thành tích đã đạt được chúng ta hoàn toàn có cơ sở để tin tưởng rằng Chương trình Đào tạo Cử nhân Khoa học Tài năng của Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội sẽ góp phần không nhỏ vào việc nâng cao chất lượng đào tạo và đổi mới giáo dục đào tạo những nhà khoa học và công nghệ xuất sấc đáp ứng yêu cầu cao của sự nghiệp công nghiệp hoá và hiện đại hoá đất nước.