Đợt 1 kỳ thi tuyển sinh sau đại học vào ĐHQGHN năm 2006 được tổ chức tại 4 địa điểm thi: Trường ĐHKHTN, Trường ĐHKHXH&NV, Trường ĐHNN và Khoa Quản trị kinh doanh. Công tác coi thi được thực hiện nghiêm túc, an toàn. Không để xảy ra các sự cố lớn liên quan tới đề thi, thí sinh dự thi, cán bộ coi thi.

Theo Ban chỉ đạo tuyển sinh sau đại học của ĐHQGHN, trong tổng số 2.037 thí sinh tham gia dự thi (đạt tỉ lệ 89% thí sinh đăng ký dự thi) có: Thi đào tạo Thạc sĩ: 1.654 thí sinh; thi đào tạo Tiến sĩ: 189 thí sinh; thi lấy Chứng chỉ ngoại ngữ: 194 thí sinh. Số thí sinh bị kỷ luật là 34, trong đó: có 1 thí sinh đến muộn không được thi, 2 thí sinh bị khiển trách và 31 thí sinh bị đình chỉ thi.